Chisinau rassemble la quasi-totalité des hôtels du pays. La capitale aligne des enseignes internationales, des hôtels d'affaires et de petites structures indépendantes. Balti, Orhei, Cahul et Comrat disposent d'une offre réduite, suffisante pour une étape. La Moldavie n'a pas d'accès à la mer et ne compte donc aucune station balnéaire. Le parc hôtelier reste modeste en volume, ce qui rend la réservation utile pendant la fête nationale du vin, au début du mois d'octobre.
Les tarifs comptent parmi les plus bas d'Europe. Une nuit en dortoir d'auberge revient autour de treize euros. Un hôtel économique se situe entre trente-cinq et cinquante euros la chambre double. Les établissements de milieu de gamme de la capitale restent généralement sous quatre-vingts euros. Le petit déjeuner est souvent compris dans le prix affiché.
Le tourisme rural s'est développé autour des sites naturels et des monastères. Des pensions familiales accueillent les voyageurs à Butuceni et à Trebujeni, au pied du complexe d'Orheiul Vechi. Le village de Butuceni abrite un écodomaine aménagé dans des maisons traditionnelles. Ces adresses servent une cuisine locale et organisent la visite des environs. Le confort varie d'une maison à l'autre, mais l'accueil compense la simplicité des chambres.
Plusieurs vignobles ont ouvert des chambres et des restaurants. Castel Mimi, à Bulboaca, propose des bungalows et un espace de bien-être. Chateau Purcari, dans le sud-est du pays, loge ses visiteurs à proximité immédiate des vignes. Chateau Vartely, près d'Orhei, met des villas à disposition. Le domaine Asconi, dans le Codru, a aménagé des maisons de village. Ces adresses associent l'hébergement à la dégustation et à la table, ce qui en fait une base commode pour parcourir une région viticole.
Chisinau compte quelques auberges de jeunesse, en nombre limité. La location d'appartements entre particuliers fonctionne bien dans la capitale, à des tarifs proches de ceux des hôtels économiques. Le camping organisé reste rare et se limite à quelques terrains privés. Le bivouac se pratique librement dans les espaces naturels, la fréquentation touristique demeurant faible.